浏览数据库

用户可以通过单击导航栏来浏览数据库

数据库包含了三个模块，分别为反刍动物交互子库、饲用天然植物功能组分基础信息、功能中心。并在下拉菜单中选择一个组件来查看记录。对于每个组件其中包含指向详细信息页面的超链接。

获得反刍动物交互子库信息

用户可以在 “反刍动物交互子库”五个物种与天然植物或组分交互的十个子库，如家牛数据库-天然植物交互组件进入的页面中，选择需要获取的天然植物。在这个表格中，支持使用HERBID、FNPID 、名称和拼写进行检索。例如 “白扁豆”，“HBRB000161”等，通过点击NP_NAME进入交互页面。页面描述了基本信息包括具有可查证关联基因及注释，当然追溯了其所属化合物，并对无可用靶标的化合物进行了展示。

重要的是，这一部分实现了一个重要的表述，即 重要靶标水平 ITI 的展示。从方法上我们获取了天然植物在特定物种中的五个水平的可用靶标，包括物种可用水平-TAR(列名：nptarget_symbol)、可注释水平-AN(列名：annotate)、PPI验证水平-TAR1(列名：npcore/fccore)、生物学富集水平-TAR2(列名：npRICH/fcRICH)，显著通络的基因富集水平-TAR3(列名：npRTAR/fcRTAR)。为方便展示我们将生物学富集和通路富集的TOP5进行了图形展示。用户可以通过每个模块的“虚拟筛选”模块，找到每次筛选的具体参数作为参考。

更值得一提的是，这一模块我们为天然植物在物种的过程归纳了16个特征，依据初始字典排序，形成了特有的特异性指纹模块表征天然植物影响的反刍物种过程。用户可以在这个模块获取“指纹”，通过“前往完整的指纹表征”可以获取每个特征下的数据及16个子模块指纹。在该模块中，我们已经实现了指纹的初步应用-数据点相似性筛查。通过图形矩阵我们计算了图谱之间的谷本相似性，可为研发与功能比对工作提供数据基础。在“反刍动物交互子库”模块中，我们可以获取关于天然植物在反刍物种中过程的三大功能，是获取数据较全的模块。

查看每个条目详情页面

用户可以通过单击饲用天然植物功能组分基础信息模块下特定项目的超链接从 '浏览' 页面选中条目进入详细信息页面。

• 饲用天然植物基本信息组件部分，例如白扁豆，第一部分包括有关它的描述性信息和该条目去往反刍物种的链接指向。其他选项卡中通过表格和图像的形式表述了天然植物的功能组分组成，天然植物中功能组分与相关靶标的联系，通过和弦图展示了含有靶标较多的功能组分 和在多数组分中表征的靶标。

• 饲用天然植物功能组分组件中摘要信息由成分2D结构、名称、别名、配方、分子微笑、分子重量和其他数据库中的外部 ID 组成，可用于导航到其他数据库。在这一部分我们对化合物所涉及的靶标是否可以在不同物种中可用也进行了表征。同样的，涉及到化合物的天然植物信息也被表征在表格。

• 靶标信息组件，用户可以通过基因symbol进入对靶标的详细信息获取以及额外分析，需要注意的是，不同物种从基因symbol进入的页面是不一致的，包含了其在特定物种下索引到的基因组数据。这个部分包括了基本信息、基因详情、基因组相关和其他数据库的交叉引用信息。在靶标页面我们重要的工作是指示了其在对应物种中的生物学注释信息并通过饼图阐述了大致分类。额外的，我们加入了一些分析，该物种靶标在化合物以及天然植物中的回溯也被页面呈现，并根据研究完成的靶标重要水平排序的数据，对靶标是否在所有天然植物和功能组分的重要性进行了表格和图像的表征。

功能中心

用户从反刍子库中的具体天然植物的描述中跳转到虚拟筛选和指纹信息模块。在功能中心包括提供了快速调转的链接。

• 在虚拟筛选模块包括了数据库对于靶标重要性以及生物学功能注释的富集的详细信息，用户可以获取并下载数据信息进行更进一步的分析。

• 指纹信息模块提供了十五个特征的表述，并提供了每个特征的数据，可供下载和查阅。

• 相似性是数据库通过指纹实现的一个简单功能。用户可以在功能中心进入“家牛物种生物学相似性”进入，可以获取不同天然植物之间不同特征的相似系数并进行筛查。其中每个天然植物编号提供了去往具体指纹及特征页面的链接。Combine 列数据提供了去往两两比较的页面链接。在两两比较页面，用户可以简单获取十五个特征上的相似从而实现简单筛选。我们也对其相关的特征进行了表格和图像的比较。

下载数据

有关 FNPRUM 中所有组件的信息，可以从下载页面下载。我们在数据表中提供了每个组件的统计信息。 同时，表格下方给出了每个数据组件中所有列的详细说明，以便用户快速了解数据内容。